El código genético del caupí

Vigna unguiculata [L.] Comúnmente conocido como frijoles largos, frijoles y frijoles, es una hierba anual de la leguminosa caupí. La longitud de las vainas es de unos 30 a 50 cm, y también hay caupí largos de hasta 90 cm de largo. En inglés, el caupí se llama comúnmente «caupí», mientras que el caupí largo se llama comúnmente «frijol serpiente». El caupí largo puede llamarse «frijol serpiente» porque se asemeja a una serpiente en forma, pero no está claro por qué el caupí se llama «caupí». El nombre antiguo de «Nei Jie» se debe a que después de la floración del caupí, de cada flor deben crecer dos vainas, por lo que se llama así.
Ye Lushu| Profesor de la Universidad Shu Tzu Chi

El caupí es originario de Guyana en África occidental, y ha sido domesticado desde al menos el año 2000 a. C. y se ha extendido hacia el este hasta la India, el sudeste asiático y posiblemente China. El estudio encontró que el centro de diversidad biológica del caupí se encuentra principalmente en el este y Sudáfrica, e India debería ser su centro de origen secundario. El caupí en Taiwán fue introducido por los antepasados ​​durante las dinastías Ming y Qing. Los centros de producción actuales se concentran en Pingtung, Kaohsiung, Changhua y Yunlin.

Los frijoles de caupí maduros se pueden cocinar directamente o molidos (en polvo) para cocinar. Las vainas tiernas y las hojas se pueden usar como vegetales. Son cultivos de leguminosas muy importantes en África tropical y subtropical y Brasil. En África, el hoppin ‘John, que se cocina con guisantes de ojo negro (una especie de caupí), arroz, cebolla y tocino (o lomo de cerdo, patas de cerdo, salchicha campestre) es un plato importante de año nuevo. La harina de caupí también se puede utilizar para los bebés Alimento complementario al destete.

Debido a que el caupí es tolerante a la sequía, resistente al calor y tiene bajos requisitos en el suelo, en este momento de calentamiento global y sequías e inundaciones una tras otra, la importancia de tales cultivos para nosotros es evidente; para comprender mejor sus características, la Universidad de California, EE. UU. El equipo de investigación de la rama de Hama completó la secuenciación del genoma en 2019.

El caupí tiene un genoma de 519Mb, un total de 22 cromosomas y una proporción de GC del 32,99%, que es similar a otras leguminosas. El análisis por computadora mostró que el caupí puede tener 29,773 genes y alrededor de 12,514 genes pueden tener empalme alternativo. Aproximadamente la mitad (49,5%) del genoma está compuesto por secuencias repetidas, especialmente en la vecindad de la sección media del cromosoma. El grupo más grande de estas secuencias repetitivas son los elementos transponibles (TE), y la familia Gypsy que representa la mayor proporción son los elementos transponibles. En comparación con otras plantas del género Caupí, se encuentra que la diferencia en el tamaño del genoma en este género se debe principalmente al factor de inversión de esta familia. Una vez completada la secuenciación, el equipo de investigación volvió a numerar los cromosomas del caupí basándose en las similitudes entre los genomas del caupí y el frijol rojo (Phaseolus vulgaris).

Mientras secuenciaba el genoma, el equipo de investigación encontró una secuencia invertida de 4.2Mb en el cromosoma 3. Un análisis más detallado del caupí silvestre encontró que esta secuencia invertida solo existe en unos pocos genes del caupí cultivado. Dado que este cromosoma contiene genes que interactúan con la planta parásita Striga gesnerioides, queda por estudiar en el futuro si este fenómeno afecta la resistencia del caupí a la striga gesnerioides.

referencias:

  1. D’Andrea; et al. (2007). Caupí domesticado temprano (Vigna unguiculata) de Ghana central. Antiquity. 81 (313): 686–698. Doi: 10.1017 / S0003598X00095661.
  2. Perrino, P .; Laghetti, G .; Spagnoletti Zeuli, PL; Monti, LM (1993). Diversificación del caupí en el Mediterráneo y otros centros de cultivo. Recursos genéticos y evolución de cultivos. 40: 121-132. Doi: 10.1007 / bf00051116.
  3. Stefano Lonardi et. Al. El genoma del caupí (Vigna unguiculata [L.] Walp.). The Plant Journal, 2019; 98 (5): 767 DOI: 10.1111 / tpj.14349


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